В 1832 – 1833 гг. через 8 лет после экспедиции Литке на маленьком парусном карбасе прошел в Карское море и выполнил подробное описание юго-восточного берега Новой Земли. Здесь он впервые вел регулярные метеорологические наблюдения. Для съемок совершал пешие экскурсии и плавания на лодке. Так на карте появились обозначения новых мысов, островов, заливов, в том числе заливов Литке и Шуберта. Во время следующей экспедиции, в 1834 – 1835 гг., Пахтусов провел съемку пролива Маточкин Шар, но льды раздавили судно, и находившиеся на его борту люди были спасены случайно зашедшим в этот район промышленником.
Уже на другом карбасе тяжело больной Пахтусов прошел Маточкиным Шаром и описал восточный берег Новой Земли. Вернувшись в Архангельск, через месяц скончался. Самоотверженному исследователю Арктики на средства, собранные штурманами русского флота, установлен памятник в Кронштадте.
Годы жизни 1800 – 1835